，杜绝了相权的反客为主，使皇权不再依赖相权，皇帝得以牢牢控制着统治权，而且由于是直接传达皇帝指令，所以军机处的办事效率非常高，由以往的层层机构辗转交送变为一切均由大臣和章京通同办理，如皇帝有谕，随时奉诏承办，必须当日事当日毕。
这一机构的设置，保证了政令畅通，大大提高了办事效率。
以及密折制，大家都知道，奏折是君臣之间的私人通讯，密折是提奏人将奏文写在折叠的白纸上，外加上特制皮匣，皮匣备有了两份钥匙，一份给奏折官员，一把由皇帝保管，任何人都无法开启，皮匣子由专人直接送达御前，由皇帝亲阅。雍正帝是密折制度的推崇者和完备者，一登基，便开始积极推行密折制度，下谕旨：“所有皇考朱批谕旨，俱着境谨封固进呈；若抄写、存留、隐匿、焚弃，日后发觉，断不宽恕，定行从重治罪”。
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