龙之建议，废除“与三大贝勒俱南面
八团龙朝袍的皇太极
八团龙朝袍的皇太极
坐”、共理朝政的旧制，改为自己“南面独坐”，突出汗位独尊地位。[3435]继而寻机削除异已，铲除了威胁汗位的三大贝勒势力，使汗权得到巩固。仿明制，设内三院，六部，“停王贝勒领部院事”，独主政务。又设都察院和理藩院，建立起一套较为完备的国家机构。
天聪七年（明崇祯六年，1633年）六月初二日，皇太极在一次讲话中谕令将士对新附之众，“一切勿得侵扰”。[36]在皇太极影响下，明将孔有德、耿仲明、尚可喜等纷纷归降了后金。皇太极率诸贝勒出迎至浑河，行抱见礼，以示优隆[37]。孔、耿不仅带了一万二千多精壮官兵及红夷大炮等，而且加速明朝的辽东海防的瓦解。[38]之后不到四个月，明镇守广鹿岛的副将尚可喜就步了孔、耿后尘，皇太极称赞他“识时势之向背”，“残破海防，实为我功”。[39]到天聪七年（明崇祯六年，1633年）马光远统领汉兵时，实际形成了一个汉军旗，满语叫乌真超哈。[40]孔、耿、尚所领兵也是汉军。在此之前，蒙古旗兵也已形成。天聪八年（明崇祯七年，1634年）三月十三日皇太极在沈阳城郊阅兵，参加的有满洲八旗、蒙古二旗、旧汉兵一旗，共十一旗。[41]
称帝改元
李自成退入山陕之后，原明朝降官降将纷纷反水，但他在顺治元年（明崇祯十七年，1644年）六月仍积极准备反攻。另一支农民军在张献忠率领下已建大西国于成都，统一了全川，而多尔衮对此尚不了解[42]。残明势力已于五月中拥戴福王朱由崧为帝，定都于南京，改年号为弘光，尚拥有中国南部的半壁富庶江山，兵多粮足，构成清朝统一中国的障碍。