控制，狂暴着也各自飞到船外
火焰肆虐着天空、雷电破坏着大地、极寒的冰雪给生物们造成伤害，三鸟暴走后，没有理智的破坏着一切，导致这个世界的温度也在不断降低，大量的宝可梦向着不同的地方突然的迁徙
可是超梦对这一切视若无睹，抱着小智他们来到雷之岛后，小智虽然有万般想说，但也知道当务之急是阻止纷乱，于是进入岛屿直取雷之宝珠，然后拜托超梦将他们送到亚西亚岛的人面前，去了解下一步方案
在保护罩里待着的这段时间，他们终于有了空闲，但是奈何这只超梦的速度特别快，一晃便是个好几十公里的距离，这种状态下他们也无法对话
在行程中，看到某种岛屿上的芙萝拉，于是转换目的地，往那边赶去
“小智，你们没事吧，这只宝可梦是？”，芙萝拉似乎也在这里等着他们
“他是叫做超梦，对吧”，小智终于有了时间，给各位介绍
“恩！我帮你解决这次危机，你之后也要帮我一个忙，帮我劝说那个家伙”，声音较为柔和的超梦看上去似乎也有自己的目的
“现在不是闲聊的时候，快把宝物放在那里啊”，芙萝拉身边的一只河马王心急如焚，心想这都什么时候，还这么悠闲的聊天呢
“哦”，小智反应过来，立马答应，把火之宝物和雷之宝物放到了祭台对应的位置上。
“三只圣鸟，要来了”，超梦感应到了对方
与此同时，海面上出现一道旋涡激流，将准备前来的三圣鸟挡在外面，从里面缓缓升起了一只银白色的大型宝可梦
“海之神，洛奇亚”，河马王望着洛奇亚呆呆的念叨
“洛奇亚，我有事找你帮忙。不过在那之前借给我们力量阻止三圣鸟的斗争吧，拜托你了”，小智陈恳的在洛奇亚面前
“恩”，洛奇亚了解了小智的心意，通过水力让小智缓缓升空，和皮卡丘一起来到了自己的背面，然后承载着小智往三圣鸟那边飞去，去阻止他们，后面的超梦也跟了上去
闪电鸟的怒吼在天空降下无尽落雷、火焰鸟的圣火也开始往其他颜色转变，暗淡的火焰在天空四处扫射，急冻鸟的暴风雪在天空无边无尽
三圣鸟各自破坏着，也各自攻击着，似乎已经不能再称之为三圣鸟了，应该是三魔鸟，不过好在洛奇亚载着小智赶到，一道高空爆破直接吹散了暴风雪，刮起的台风将火焰也给熄灭，并将落雷全部引入其中，而那只超梦并没有进攻，只是在一旁其掠阵作用
海之神只有在拯救世界的时候才会出现，不过也无法阻碍世界的灭亡”，芙萝拉看着天空中和火焰鸟、闪电鸟、急冻鸟缠斗的洛奇亚说道，看来她知道一直流传的传说。
“对啊，如果传说正确的话，笛子就可以了”，芙萝拉想起了一直流传下来的传说，于是拿出笛子，开始吹奏起来，‘呜~呜~呜~~呜~呜呜呜——’，随着芙萝拉的吹奏，悠扬的笛声开始向四周扩散，让人感受了宁静。
在洛奇亚身上的小智也注意到了洛奇亚现在身上散发着虹色的光泽
“我要感谢一下，感谢抚慰我的笛声，但是凭此笛无法抚慰三只神奇宝贝，只有当火之神、雷之神和冰之神拥有的宝物与海之笛调和的时候，才能消除他们的愤怒，能完成这件事的只有优秀的指挥者——人类”，而后洛奇亚通过心电感应向小智和芙萝拉表达了解决这次事情的方法。
“那就交给我吧”，小智当仁不让的战了出来
“只剩下冰之宝物一件了，我觉得会的到手！然后阻止三圣鸟的斗争”
“在那之前，就拜托你了，洛奇亚。还有就决定是你们了、巴大蝶、卡咪龟、喷火龙”，小智临走前还派出三只宝可梦来支援洛奇亚，与其一同作