阿尔宙斯是在一个月以后苏醒的，它醒过来以后就很高兴的告诉赵方，它已经恢复了全部的实力，可以随时分离这两个世界，而至于什么时候选择分离，只需要赵方自己来确定就可以了。
不过赵方并不打算拖太久，这段时间又发生了很多事情, 大师赛的举行被打断了，各个剧场版的故事都在发生，然后还钻出来了黑暗洛奇亚黑暗超梦等等奇怪的宝可梦，根据阿罗拉地区的库库伊博士所说，似乎有一个名为彩虹火箭队的组织也出现了。
这个世界乱成了一锅粥，赵方也深刻的体验到阿尔宙斯为什么会说这两个融合的世界如果不分开，那么一起就都无法挽回。
游戏世界和动漫世界的融合导致了很多的问题，现在这些问题开始加速爆发, 甚至出现了一些赵方自己都不知道的东西，大师赛也因为这些原因被暂时停赛了，赵方和大吾的比赛也被暂停了。
唯一的好消息大概就是赵方的多龙巴鲁托成功的吸收了反转世界的能量，成为了更强的神兽，反转世界的主人，如果赵方愿意的话，他可以随时依靠多龙来击杀那些其他的神兽，然后成为这个世界的新主人，不过赵方拒绝了，他不喜欢这个世界。
“阿尔宙斯，我可以带走我的那些同伴吗？”赵方期待的看着阿尔宙斯，他记得阿尔宙斯说过可以带走父母和小光，但是如果还可以带走那些冠军不是更好？
“不行，你的多龙吸收了反转世界的能量，如果想要让你的多龙能够跟着你去新的世界，那么你最好放弃这个想法。”阿尔宙斯摇了摇头，世界是有承受上限的，多龙现在的实力过去还可以接受, 但是太多不属于这个世界的人过去终归会引起排斥反应，这是世界的自我保护。
也是因为这个自我保护，所以阿尔宙斯在融合两个世界的时候，才会遭到重创。
赵方皱着眉头，可惜多龙没办法放弃自己的实力，不然的话赵方觉得之前那个霸主多龙就挺好的。
和阿尔宙斯说了一下后，赵方并没有立马开始重启世界，而是和自己的朋友们一一告别，顺便也和超梦说了一下这个事情，超梦没有任何犹豫的就钻进了赵方的精灵球里，它愿意和自己的朋友一起离开。
大木博士也知道了，毕竟这个事情发展到了现在也没有什么可以隐瞒的地方，大木博士的表现很平和，他笑呵呵的拉着赵方介绍了一下赵方之前给他的那些科研资料和克隆装置，在大木博士的研究之下，现在这些克隆装置大变样。
在牺牲了制作成熟体准神兽的能力后，克隆装置终于取得了一些进展，不过大木博士却把这克隆装置做成了加速孵蛋器，本来一颗精灵蛋需要很久时间的孵化, 而现在孵化的时间被缩减了。
“我不希望人们都拿着强大的宝可梦去踏上旅途, 即便是弱小的，只要是自己喜欢的，那么就是一个不错的旅行。”大木博士是这么说的。
赵方最后和冠军们一起聚会吃了个饭，大家都没有提关于世界分离后的事情，只不过大家的情绪也不是很好，但是出乎赵方意料的是，赵方的父母在知道这个真相后，拒绝了和赵方一起去新的世界。
而这个时候，赵方的父母也才知道了他们的儿子已经死在了那个时候，现在的赵方只不过是另外一个人的灵魂，正是因为这个原因，赵方的父母拒绝了，他们伤心的离开，而赵方也只能沉默的低着头。
“我可以陪着你吗？”小光握住了赵方的手，她温柔的笑着。
赵方不由得笑了一下，然后点了点头。
赵方没有选择带其他人，这两个名额放出去还是一件坏事，而赵方本来是想让小光带上她的父母，但是小光的父母也拒绝了，他们还是喜欢这个自己生活过的世界，所以最后，只有赵方和小光站在了阿尔宙斯的面前。