经过三天的准备，清军在太平门地下的地道中装入了七千斤火药。等城内明军所有注意力都被聚宝门和正阳门吸引过去后，才点火炸塌城墙。
清军这次偷袭很成功，七千斤火药将太平门边上的城墙炸塌了二十多米。埋伏在一里地外山中的多铎，看到大功告成，对身边的所有将领说道“诸位，城破就在今夜！一会儿跟着本王一同进城，进城后屠城十日，杀光所有没剃头的汉蛮子！”
所有将领在南京城下吃瘪半年，早已经憋了一肚子怨气，听多铎这么说纷纷叫嚷“杀光汉蛮子！十王千岁！”
“好，勒克德浑，你带领三千两白旗将士为先锋！巴图，你带领五千人蒙古八旗做后队支援勒克德浑，其他所有将领都与本王一同进城！”
多铎的命令发布下去，作为副将的勒克德浑带着三千两白旗主力第一个冲进南京城。这时城墙上的明军都被火药的冲击震晕了，再加上人数比清军少，很快这段负责防守这段城墙一千多明军被砍杀殆尽。勒克德浑很容易在城内建立了据点，其后的援军如同潮水一样冲进南京城。
马锡的指挥部距离破口处并不太远，刚才的震动震塌了都察院的几栋房子，马锡从瓦砾中钻了出来，拉住一个士兵叫道“快去，快去看看怎么回事？”
不用那个士兵去查看，很快消息传了过来，距离马锡指挥部三百米处的城墙被炸塌二十多米的口子，清军大队已经攻进城内。
马锡听到这个消息大吃一惊，呆了一会儿马锡并没有组织有效抵抗，而是带上二十多个亲兵，转身逃往北城。
指挥官的逃跑让明军乱成一团，这时东城副将谢广坤正在龙广山指挥炮兵，马锡的逃跑让明军马上陷入群龙无首的状态。太平门参将安镇西看到情况不妙，原本也想学马锡逃跑，但是安镇西想到马铖对自己兄弟的大恩，原本安镇西只是贵州一个土兵，要不是马铖的赏识和提拔，他们兄弟怎能做到参将的高位？
想到这安镇西咬了咬牙，抄起兵刃，砍死一个逃跑的明军，然后站在高处喊道“所有人不准退，逃跑就是这个下场！现在听老子的号令，都跟着老子去杀敌！”
安镇西虽然站出来组织抵抗，可是他的职位太低，只有不到三百人跟着他一同出了都察院衙门，其他大部分士兵都往北城逃去。
安镇西带着这三百人刚出都察院衙门，就看到不远处的街角冲过来一伙身穿白衣服的清军，两帮都已经发现对方，马上冲在一起混战起来。
安镇西带领的三百人只有不到一百人是新军，其他大部分都是卫所军，这些人如果碰到清军的汉军旗还能打一打，可是碰到主力中的主力两白旗，那就根本不是对手了。
没有十分钟，安镇西的三百人死伤惨重，安镇南身中六处刀伤，看到这个情况安镇南知道不行了，他拉过一个百户叫道“快去给军门大
人送消息！还有跟老子哥哥说，让他给老子报仇！”
安镇西在死战的时候马铖已经赶到应天府衙门，现在情况不明，南城清军还在攻城，马铖可不敢随便抽调南城的守军支援东城，没办法只好使用自己的预备队了，那五千神机营。
马铖的神机营绝对是最精锐的存在，这支军队虽然数量只有五千人，但是全部装备了火铳，还装备了一百门最新式的火炮，战斗力在明军中最强。
因为满清攻城，神机营在两位游击顾长卫与许大虎的带领下，早已经准备好，就等城墙那地方出现险情好支援。马铖马不停蹄赶到神机营驻扎的承恩寺，对顾长卫与许大虎叫道“你们两个，带上所有手下，跟着老子去东城！”
顾长卫原本是马铖的常随，与马铖的关系很近，这时赶紧凑上来问道“军门大人，刚才东城出现火光与震动，是不是城破了！”